درمان شقاق مقعدی یا فیشر از اهمیت بالایی برخوردار است. درمان این بیماری به نوع آن و شدت بیماری بستگی دارد که باید حتماً توسط پزشک تجویز شود. بسیار مهم است بیماران با مشاهده علائم شقاق مقعدی دست به خوددرمانی نزنند و با مراجعه به پزشک یک روش مناسب را برای درمان بیماری خود انتخاب کنند. روش درمان شقاق با استفاده از مراقبتهای خانگی، دارودرمانی، جراحی و لیزردرمانی امکانپذیر است که با توجه به وضعیت فرد توسط پزشک انتخاب میشود.